1. Beasiswa dan Penghargaan Mahasiswa
Keputusan Rektor No 49 th 2013 tentang Pemberian Penghargaan Kepada Mahasiswa UAJY yang Berprestasi Pada Kegiatan Ekstra Kulikuler Bidang Penalaran dan Minat Bakat2. Cuti Mahasiswa
Keputusan Rektor No 122 th 2020 tentang Perubahan Ketentuan Mahasiswa Cuti Studi dan Mahasiswa Tidak Aktif Program Sarjana dan Program Pascasarjana UAJY3. Pemutusan Hak Studi Mahasiswa
SK Rektor No 120 th 2020 tentang Pemutusan Hak Studi Mahasiswa Program Sarjana (S1) UAJY Setelah 6 (Enam) TahunSK Rektor No 121 th 2020 tentang Perubahan Ketentuan Pemutusan Hak Studi Mahasiswa Program Pascasarjana UAJY
4. Kartu Mahasiswa
SK Rektor No 280 th 2015 tentang Kartu Mahasiswa Mahasiswa UAJY5. Remidi
Peraturan UAJY No 91 th 2017 tentang Perubahan Ketiga Peraturan Program Remidi UAJY6. SPAMA
Keputusan Rektor No 30 th 2011 tentang Penerapan Sistem Partisipasi Aktivitas Mahasiswa Atma Jaya (SPAMA)7. Pedoman Perilaku Mahasiswa
Peraturan Universitas No 168 th 2013 tentang Pedoman Perilaku Mahasiswa Universitas Atma Jaya Yogyakarta8. Predikat Kelulusan Mahasiswa
Keputusan Rektor No 56 th 2015 tentang Perdikat Kelulusan Bagi Mahasiswa Program Sarjana dan Program Pascasarjana niversitas Atma Jaya Yogyakarta8. Penulisan Pada Ijazah
Keputusan Rektor No 402 th 2015 tentang Penulisan Nama, Tempat dan Tanggal lahir Pada Ijazah Program Sarjana dan Pascasarjana Berdasakan Akta Kelahiran9. Peserta Wisuda
Keputusan Rektor No 412 th 2015 tentang Ketentuan Peserta Wisuda Mahasiswa Program Sarjana dan Pascasarjana Universitas Atma Jaya Yogyakarta10. Pelaksanaan KKN dan Wisuda
Peraturan Rektor No 140 th 2012 tentang Pelaksanaan WIsuda dan Kuliah Kerja Nyata Universitas Atma Jaya Yogyakarta11. Penilaian Hasil Belajar Mahasiswa
Peraturan Universitas No 90 th 2017 tentang Penilaian Hasil Belajar Mahasiswa Program S1 dan S2 Universitas Atma Jaya Yogyakarta12. Ijazah Program S1 dan S2
Peraturan Universitas No 17 th 2022 tentang Pembuatan Ijazah, Transkip Akademik dan Surat Pendamping Ijazah UAJYKeputusan Rektor No 75 th 2023 tentang Perubahan Nama Program Studi, Gelar dan Penulisan Gelar Pada Ijazah Program Sarjana dan Pascasarjana UAJY